慈禧太后想到了统兵平定太平军的股闳重臣曾国藩，随之传谕两江总督曾国藩核查上奏。曾氏痛恨逃帅，主张重惩，立即回奏：苏、常失陷，卷宗无存。司道请移之禀，无容深究。疆吏以城守为大节，不宜以僚属一言为进止。大臣以心迹定罪状，不必以公禀有无为权衡。
何桂清早就投奔在恭亲王门下，他和恭王的岳父桂良关系密切。
大臣会议，主张斩监候，秋后处决。这一年是停勾之年，意味着何氏可以再活一年。但是，慈禧不想放过何桂清。
同治元年十月二十一日，慈禧太后确定何桂清为弃城逃跑罪，判处死刑，立即处决，并派大学士管理刑部尚书周祖培、尚书绵森监视行刑。
慈禧太后杀的第二位大臣是在祺祥政变中有拥护之功的统兵大员胜保将军。
政变成功之后，慈禧太后感恩，下旨将四品京堂候补降职的胜保，超擢为二品兵部侍郎。随之将其镶蓝旗汉军副都统，升为皇帝自将的上三旗正黄旗满洲都统和正蓝旗护军统领。
可是，谁曾想，同治元年十一月，慈禧太后一道密旨，将胜保逮捕拿问，半年后令其自尽。
胜保手握重兵，大权在握，春风得意。胜保仰慕恭亲王，愿意听其号令，他小视女人，对慈禧太后不卑不亢。
恭亲王授胜保为钦差大臣，督办陕西军务。他拥兵自重，养寇自固。最为致命的是，他自作主张，不完全听从慈禧太后的吩咐。曾国藩、李鸿章统领湘军、淮军，唯慈禧之命是从，都怕功高盖主，惹来杀身之祸。胜保不管这些，我行我素。
光禄侍卿潘祖荫、御史丁绍华等上书，弹劾胜保骄纵贪淫、滥用军饷、携妓随营等等。
慈禧太后命钦差大臣科尔沁亲王僧格林沁调查，又指示山西巡抚英桂等密查。回奏都是罪状属实。胜保除携带姬妾随营一条认罪之外，其余一概不承认。
慈禧太后在发布处决胜保的上谕中，称他挟制朝廷。这是处决胜保真正的原因。
临刑之前，胜保反复请求面见太后，最后大声痛哭地哀求侍卫，请求见太后一面。
慈禧太后一声冷笑，置之不理。
这是垂帘听政的执政之初，慈禧太后连杀两位大臣，一文一武，都是一品大员、封疆大吏！
杀伐之下，朝野震动。人们开始担惊受怕，特别是那些封疆大员，生怕太后的屠刀指向自己。
