这场冤案，就此大白于天下。京城、地方正直之士，无不切齿痛恨浙江巡抚杨昌濬、浙江学政胡瑞澜，想生吃其肉！
可是，刑部尚书桑春荣年迈而平庸，还是不想得罪这许多的封疆大员，想从轻处置。大小官员们也从自己的私利出发，不想治陈巡抚、刘知县之罪，特别是刘知县与大学士宝鋆是乡榜同年！
曾以杀安德海闻名的丁宝桢，时任四川总督，这时正在北京。他听说此事之后，认为杨乃武风流成性，不是什么好东西。他听说这是冤案，已经大白于天下，在朝堂不禁大怒，认为刑部不应该对此案平反，承办此案的地方官员没有失职，主张维持原判。他扬言说：葛品连死了三年，毒消骨白，据此不足以定虚实！
丁宝桢听说刑部要追究浙江巡抚的责任，将他革职，并惩处有关官员，不禁大怒，竟然跑到刑部大堂，咆哮如雷，当面指责桑春荣尚书糊涂，威胁说：如果要翻这个铁案，将来就没有人敢做地方官了！
湖南、湖北籍的在京官员，也持此议，附和维持原判。
经丁宝桢这一惊吓，加上许多大臣的附和，本来就胆小的刑部尚书桑春荣就不知道该怎么办了。这样，结案的参革之折，一改再改，一拖再拖。
浙江巡抚带重金入京，四处行贿。另一刑部尚书皂保得了厚贿，公开主张不予平反。许多受贿大臣，或者是因同乡、同谊、同年等特殊关系的大臣出面为此案开脱，一时之间，朝野上下，闹得乌烟瘴气。
帝师翁同、夏同善等人上书慈禧太后，明确指出：刑部提审勘验，系奉旨办理。现在，案情既然大白，就应该据实判决。
生性倔犟的帝师夏同善，还特地与翰林院编修钟骏声、国子监司业汪鸣銮等28人，联名合词，赴刑部为杨乃武案鸣冤。
慈禧太后召见翁同，询问杨案的结果。翁同介绍了京师和地方官员对此案的敷衍、拖拉，一再陈奏，认为必须平反。
慈禧太后表示赞同。翁同遂授意御史王昕，上书弹劾浙江巡抚和浙江学政杨、胡等人枉法欺君的行为，称他们肆意妄为，无所顾忌：若此端一开，以后更无顾忌，大臣尚有朋比之势，朝廷不无孤立之忧！伏请严旨查办，以肃纲纪。
慈禧太后对交办的钦定大案，官员们如此拖拉，十分生气。览奏之后，对这些欺君罔上的官僚们越发震怒，下旨彻查严办。最后，翁同提出了一个解决方案，慈禧太后赞同，正式颁发谕旨：自浙江巡抚杨昌濬以下，所有涉案官员，分别情节轻重，给予革职、充军等处分。
史官记载称：居中主持平反者，确为翁叔平。翁之背后，或必有恭邸隐为之助。
慈禧太后觉得，小白菜在这场命案中虽然是冤枉的，但她的行为也存在问题，她怎么能容忍像刘公子和衙役这样的货色一次次的非礼？
